相對論對於解釋浩瀚的宇宙很有用，但不適合解釋微觀世界的粒子。這是因為在機械論世界觀的影響下，相對論也預設了嚴格的連續性、嚴格的決定論（Determinism）和嚴格的局域性。然而，量子力學則預設了如下的不連續性、非決定性和非局域性。
圍繞原子核運行的電子沿著特定軌道移動，因此電子不能存在於兩條軌道之間。然而，當電子改變軌道時，它會立即從一條軌道「跳躍」到另一條軌道去。也就是說，「不用跨越」軌道和軌道的間隙就直接換了一條軌道。這種非連續性是無法用機械論世界觀來解釋的。
所有物質和能量同時具有這兩種屬性，根據周圍環境（無論是實驗還是觀察）的脈絡，它們有時表現得像粒子，有時又像波，這也推翻了機械論的世界觀。因為在機械論世界觀中，特定的粒子或物體不會隨著周圍環境而改變其本質。然而，量子力學中的粒子會像生物一樣，根據環境改變自身的外觀。換句話說，粒子處於疊加狀態（superposition），其中兩種狀態都是機率性的，而且它們的性質是非決定性的。
在量子力學中，粒子具有非局域連結性。所謂「局域性」（locality）是指特定的物體位於特定的空間位置，但很難將此特性套用在微粒子上。因為一個粒子可以同時存在於兩個地方，相隔遙遠距離的兩個粒子之間也會強烈糾纏。在機械論世界觀中，這是不可能的，因為只有彼此接近的事物才會相互影響。
機械論世界觀完全無法解釋這些粒子的特性，這表示這個世界觀存在著根本上的問題。。這些粒子清楚地顯示出「所有東西都是透過無形的連結糾纏（woven together）成一整塊」。
戴維．玻姆思考過該如何克服微觀世界的量子力學和宏觀世界的相對論之間的這種差距，以及如何整合這兩個理論架構。他認為，與其著眼於兩個理論系統的差異，不如先從兩個理論系統的共同點著手，而這個共同點就是宇宙萬物是一個「不可分割的整體」（unbroken wholeness）。
根據玻姆的看法，既有的量子力學和相對論都深受機械論世界觀的影響。從基本上將粒子或部分視為實體、將整體視為「剩餘」概念的這個層面來看，也是如此。玻姆主張，我們必須從根本上改變機械論世界觀的觀點，這個世界觀認為「整體的概念不需要存在，那是為了方便思考，抽象地創造出來的」。人類任意創造的抽象概念不是「整體」，而是「部分」。量子力學一貫顯示，所有事物都有機地形成「一個整體」，而玻姆提出的宇宙外觀則是一個「有機的整體」（organic whole）。
宇宙原本是一個整體，但在人類任意地區別、分割、概念化之下，創造出了許多「部分」。構成機械論世界觀基礎的元素是透過人類認知作用所分割的抽象化、概念化的存在。而玻姆的立場是，人類任意地將原本是一個整體的宇宙分成各個部分，並將其概念化，試圖透過因果關係來解釋它們，但這種方法無法正確解釋宇宙的真實面貌。
玻姆認為，宇宙從一開始就是「作為整體的單一」或「作為單一的整體」，人類所認識的個別物體是那些在單一整體中發生某種局域性能量流動或凝聚而成的物體（就像風一吹平靜的水面上掀起波浪一樣），只不過每一個這樣的凝聚（拔地而起或形成的波浪）被抽象化（概念化）成為一個個的個體。換句話說，從大物體（銀河系）到小物體（微粒子），無非就像由一個形成大海的質量體中所冒出來的大大小小波浪一樣。
人類任意地將作為大海一部分的「波浪」分離出來成為獨立的實體，並試圖解釋波浪之間的相互作用和因果關係，這就是到目前為止的機械論世界觀。個別的獨立波浪之間看似相互影響和相互作用的真正原因，是因為這些波浪都是大海的一部份。機械論世界觀試圖將大海理解為單個波浪的集合，這根本就是主客顛倒。想理解波浪的本質，就必須觀察整個大海。先理解作為整體的大海，才能理解作為部分的波浪。部分只有透過整體才能理解，就像我們不可能透過波浪來理解大海，而是透過觀察作為整體的大海來理解波浪。古典物理學妄圖透過部分之間的相互作用或因果關係來理解整體的世界觀，根本就是本末倒置。
玻姆將從機械論觀點解釋個別事物關係的基本框架，稱為「顯秩序」（explicate order）。在顯秩序中，作為「部分」的物體向外展開及延伸。另一方面，從整體性的角度來看，宇宙被視為一個巨大的整體，個別物體被理解為具有向內折捲及延伸的「隱秩序」，而不是具有外在的關聯。
如果說「顯秩序」是指這些物體像撞球的球一樣，在保持獨立而獨特的個別性之際，也形成一個整體，進行外在相互作用的話，那麼「隱秩序」就是指物體像生生不息的波浪，作為大海的一部份進行內在相互作用。撞球的球會在撞球檯上進行「向外展開」，而波浪則會重新回歸大海，進行「向內折捲」。
玻姆認為，宇宙的運作原理可以在某種程度上用顯秩序來解釋（譬如用古典物理學來預測撞球或火箭的動向等），但這種情況僅限於宇宙的某些特殊情況而已，因為宇宙在本質上是屬於隱秩序的。顯秩序並不是與隱秩序對立的概念，而只是隱秩序的一種特殊形式罷了。
所有看似互不相干的獨立物體都如同漣漪或波浪一樣只是表面如此，其實宇宙是「單一的整體」。隱秩序是隱藏在表面之下的整體秩序，而顯秩序則是暴露在表面之上的一部分隱秩序。機械論世界觀就是將顯秩序誤以為是世界的本質狀態，其實顯秩序只不過是隱秩序極小的一部分，比較特殊的一種型態罷了。就比如屬於顯秩序的水面上波浪，只是屬於隱秩序的整個大海中極小的一部分一樣。顯秩序中，物體之間的相互作用是外展，而這同樣也是隱秩序運作方式——內捲的一個特殊形態而已。
無止境向內折捲的隱秩序，是宇宙的普遍樣貌和實際本質，顯秩序或外展只不過是抽象化視角的描述。也就是說，薛丁格的波動函數是隱秩序的描述，而對粒子因果互動的議論則可以說是顯秩序層面的解釋。
愛因斯坦的「統一場論」（unified field theory）可以說是在某種程度上接受了隱秩序和整體觀點的理論。這是因為粒子和成為其背景的空間及能量都被視為一個連續分佈在整個宇宙中的「場」（field）。如果把重力也包括在其中的話，它其實就成了「萬有理論」（theory of everything）。將空間這個背景和能量或粒子等實體視為同一個整體，就像將一朵朵波浪看成是大海這個背景（場）的一部分，而非獨立的粒子一樣。因此，背景和「場」在本質上沒有差別的這種看法，其實就是一種整體（wholeness）的觀點。
前面提到過的背景自我和經驗自我的概念，本質上也是同一個整體，而不是被分割成兩個實體。背景自我就像大海，經驗自我就像在特定情況下短暫出現的波浪。提高心理肌力的內在溝通訓練，可以說是超越我們在日常生活中經常能感覺到的經驗自我，覺察其背後如背景般存在的背景自我，並與之融為一體的修行過程。