推理：大腦的基本運作方式
大腦透過推理感覺資料來產生感覺訊息
到目前為止，我們探討了意識製造的單一、同步、連續、體化和被動的特性，而其結果，造就出意識這個穩定而具有一貫性的敘事主體。那麼，大腦是如何做到這一點的呢？答案就在於大腦的「推理」（inference）能力。
眼睛、耳朵和皮膚等各種感覺器官傳遞到大腦的感覺訊息，性質各不相同。大腦整合這些各具特性的不同感覺訊息後產生知覺碎片（percepts），並以此為基礎架構眼前展開的事件和物體，更進一步打造出富有意義的「我當前所處環境」的故事敘述。這裡的「富有意義」是指「在我所處的特定環境中可以高效生存」的意思。我們的大腦如何將不同感覺系統各自處理的訊息，整合為一個具有意義的經驗呢？這就是「整合的問題」（binding problem），也是長期存在於腦科學領域的難題。很明顯的，這種「整合」就是意識的實質性功能。
大腦從各種訊息中創造出單一意義的過程，首先要整合隨時都在發生的各種感覺訊息，再賦予它們意義和解釋，然後創造出一個故事，而每一個故事就成了記憶的單位。這就是為什麼對過去經驗的所有情節記憶都是由故事組成的原因。意識是它自己創造出來的即時記憶集合體，而且意識也一直自動地在敘述故事。
我們所擁有的經驗都是感覺資料疊加意識的敘事而來，痛苦、悲傷、恐懼、快樂等情緒反應取決於在特定體驗上添加了什麼樣的敘事。為了提升心理肌力而進行的內在溝通訓練，其出發點就是直接獲取意識添加敘事之前的原始感覺訊息。從現象學上來說，這是一種存而不論（epoché），從性理學上來說，這是一種未發體認5。也就是說，我們將會如實看到自身的體驗。
但是，因為我們既有的習慣，讓我們很難直接看到這些提供日常體驗的對象和事件的原始面目，所以只能採用間接的方法，那就是去覺察背景自我。如果說經驗自我是為了感受和體驗由敘事所提供的經驗而存在的自我，那麼背景自我就是為了傾聽、觀看、覺察那些經驗自我的敘事而存在的更基本、更本質的自我。雖然經驗自我會有喜怒哀樂的情緒感受，但背景自我卻沒有，它只是靜靜地覺察正在經歷各種體驗的經驗自我罷了。
透過背景自我，我們就可以認識作為經驗自我的意識平時發揮的功能。如果我們可以退後一步觀看意識自動完成的敘事過程，就不會再被這種敘事所左右，而是可以進入一種極致寧靜安詳的心境——這就是內在溝通。內在溝通不是大聲的交談，而是一種靜默。有關於覺察背景自我的內在溝通訓練法，會在第十章詳細介紹，這裡就只言及覺察背景自我是一種強大的自我參照過程的訓練。
意識為了敘事，就需要賦予意義；為了賦予意義，就需要主動推理。無論是視覺還是聽覺，在從特定感覺資料獲取某些知覺碎片的過程中，主動推理就成了不可或缺的步驟。感覺資料無法自動將我們所感知的對象具象化，我們所能獲得的感覺資料，不過是視覺細胞受光線刺激的活化，以及聽覺細胞受聲音刺激的活化而已。這些感覺資料通常透過我們的身體被引發，而我們的意識便會將各種傳進來的感覺資料，以既有的內在模型為基礎加以推理。我們的大腦所感知的全部訊息，都是意識以所謂「感覺資料」的原料為基礎加工製成的。
錯視現象是主動推理的結果
讓我們先來看看【圖5-1】。乍看之下很難立即辨識出是什麼東西，當我們觀看這種難以辨識的圖形時，大腦會比平時更快速地運轉，努力進行「推理」。大腦這麼勤快地工作，是為了決定該對這個受限的視覺訊息賦予什麼樣的意義，所以正努力尋找適當的內在模型。但是因為大腦從未見識過類似的圖像，所以視覺中樞陷入了混亂。
那麼現在再來看看位於本節末尾的【圖5-2】，很明顯地可以看出來是一頭牛。再回過頭來看【圖5-1】，現在【圖5-1】看起來也像一頭牛。在沒看到【圖5-2】時不明所以的圖像，現在再看就已經無法回到稍早前的「原始狀態」。我們的眼睛從【圖5-1】所接收的視覺資料沒有任何改變，只是讀者們的大腦已經根據【圖5-2】創建了一個內在模型。現在，我們的意識在觀看【圖5-1】時，就會自動套用最有幫助的內在模型來推理【圖5-1】所提供的感覺訊息。
不僅是對形狀的視知覺，對顏色的視知覺也強烈依賴大腦的推理能力。我們並不是因為顏色的存在而看到顏色，而是根據該物體應該是那種顏色的推理來識別顏色的。來看看【圖5-3】，看起來是一張學生們各自穿著不同顏色運動衫的彩色照片。但這張照片其實是一張黑白照，孩子們的衣服全都是黑色，只不過在孩子們的衣服上交叉畫上各種顏色的線條而已。但我們的大腦卻把「線條」的顏色推理成是學生身上的衣服顏色，並且進一步推測單件衣服應該是沒有特殊紋樣的相同顏色。當然，推理的根據來自於到目前為止生活中所經驗的各式各樣錯視訊息，也就是對色彩認知的內在模型。大腦根據色彩認知相關的內在模型，推理出學生們身上穿的所有衣服應該是黃色或淺綠色。而結果，就是讓孩子們看起來像是穿上了各種顏色的衣服。由此可知，無論是形狀或顏色，當我們看到某件物體時，其實是「透過眼睛用大腦看到的物體」，聽覺或觸覺等其他感覺系統也是如此。
再來看看另一個視覺推理的例子。在【圖5-4】中，上方物體看起來是深灰色，下方物體看起來是接近白色的淺灰色，但其實上方和下方物體是同樣的顏色。如前所述，我們的視知覺系統對於透過眼睛傳入的視覺資料，會根據既有的內在模型為基礎來進行推理。根據到目前為止的經驗，我們知道光線大部分是由上往下照射的。無論是陽光還是電燈照明，全都是由上往下照射。因此，上面的部分通常會接收到更多的光線，顯得更明亮。相反地，下面的部分會被陰影遮蔽顯得更黑暗。
在這張圖中透過眼睛傳入的上下方物體實際的顏色是亮度相同的灰色，因此我們會基於既有的內在模型主動推理，修改透過眼睛傳入的視覺資料。如果上下方物體看起來是相同的顏色，那麼大腦會做出上方物體顏色應該更深、下方物體顏色應該更淺的「推理」，並且讓我們「看見」這樣的結果，這就是亥姆霍茲所說的無意識推理機制正在自動發揮作用。
現在，試著遮蓋這張圖上下方物體之間的分界線，上下方物體馬上會呈現相同的顏色。當我們用手指頭遮住中間部分時，大腦會判斷這兩個物體是同一個區塊，因此「推理」出上下應該同色。這張圖也清楚地告訴我們，我們不是用眼睛在看東西，而是用大腦在看東西。這種推理是在無意識的層面上自動進行的，而不是我們有意識地對顏色進行邏輯性推理。因此，即使我們確認上下方同色之後，如果又將手指頭移開的話，我們還是會如之前一樣看到上下方物體呈現不同的顏色。